1、体外震波碎石：目前已经广泛运用在了直径在0.5-1.5cm范围内的结石治疗，特别是对于单个结石在1.0cm左右的结石，效果比较好，随着医疗科学技术的进步，现在的体外冲击波震波碎石越来越先进，具有治疗时间短，价格亲民，患者普遍能接受，适应症好的优点。另外，目前也已经逐渐探索将体外震波碎石运用在鹿角结石及一些特殊结石，如肾小盏结石、蹄铁肾结石、多发性大结石等治疗。
2、手术治疗：当保守治疗或者体外碎石效果不佳时，或者多发性结石反复引起尿路梗阻肾积水等情况时，多选择手术治疗。目前，有经皮肾镜取石术、经尿道取石术、输尿管肾盂镜下取石术以及开放性手术等术式。当结石的形状怪异，比如鹿角状大结石，难以排出，经过体外震波也不碎的结石，则需要考虑微创性的手术治疗，比如经皮肾镜取石。当出现严重性的尿路梗阻，严重的肾积水或者导致严重感染的肾结石，仍需要进行创伤比较大的开放性手术。
3、保守治疗：
对于单个的肾结石且直径小于1cm的，都可以考虑进行保守治疗，也就是在日常生活中多饮水，保证足够的尿量，以冲刷尿道，另外可以采用连续蹦跳15分钟的方式，促进结石改变姿势，就有机会顺着输尿管排出。如果肾结石在肾脏中极，则需要取卧位，健侧朝下，患侧朝上，这样有利于结石掉出中极，达到肾盂肾盏以外的地方，利于排出；
很多病友发现肾结石的时候采取吃药、输液等一系列治疗之后，隔一段时间复查仍然有肾结石，有的当初发现肾结石就比较大，进行了手术治疗或者体外碎石等治疗后，可能短期内都治愈了，可能过了一段时间之后，又发现了肾结石。
为减少复发的机率，因此饮食的控制格外重要，以常见的钙盐肾结石为例：
1、控制草酸的摄入：茶叶、菠菜是导致草酸摄入的主要来源，因此尽量控制茶叶和菠菜的食用，对于预防草酸钙结石具有积极作用；
2、增加钙的摄入：钙进入体内，会和多余的草酸结合，通过大便排出体外，这样就能避免草酸形成草酸盐沉积，同时也能避免多余的钙被肠道吸收，形成钙盐沉积，这样双管齐下，避免草酸钙结石的形成；
3、减少食盐的摄入：食盐的主要成分是钠，有研究指出，减少钠的摄入，能有效预防肾结石；
4、多喝水多运动：多喝水，能够保证足够的尿量，反复冲刷肾脏和输尿管，有效避免钙盐和草酸盐结石的形成，从而预防肾结石。